Abb. 3: Vereinfachtes Schema der Zöliakie: Bei einer Permeabilitätsstörung der Darmschleimhaut kann ein unvollständiger Abbau von  Gliadin-Polypeptiden zur  Bildung von Gliadinantikörpern führen. Zudem können sich deamidierte Gliadinpeptide (dGP) im Komplex mit Transglutaminase (TG) in Plaques ablagern. Doch nur Träger von HLA DQ2 oder DQ8 sind zu den spezifischen Immunreaktionen in der Lage, die letztendlich zur chronischen Entzündung und Zottenatrophie führen.